Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC38Q5VT99 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms