Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms