Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BEND3Q5T5X7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BEND3Q5T5X7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BEND3Q5T5X7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BEND3Q5T5X7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BEND3Q5T5X7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BEND3Q5T5X7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BEND3Q5T5X7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms