Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms