Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH8Q5T0T0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms