Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM74A1Q5RGS3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM74A1Q5RGS3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM74A1Q5RGS3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM74A1Q5RGS3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms