Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC158Q5M9N0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms