Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms