Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HSP90AB3PQ58FF7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB3PQ58FF7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms