Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGO2Q562F6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms