Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6CQ53S08 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms