Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms