Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC23Q53EV4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms