Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms