Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms