Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX19Q49B96 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COX19Q49B96 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms