Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SV2CQ496J9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms