Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147 ms