Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM1Q2NKQ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM1Q2NKQ1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM1Q2NKQ1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM1Q2NKQ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM1Q2NKQ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM1Q2NKQ1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms