Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCK2Q16822 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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