Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
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