Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
ECM1Q16610 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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