Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNRNP35Q16560 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNRNP35Q16560 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNRNP35Q16560 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRNP35Q16560 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms