Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ZNF56Q15929 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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ZNF56Q15929 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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ZNF56Q15929 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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ZNF56Q15929 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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ZNF56Q15929 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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ZNF56Q15929 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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