Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA6Q15825 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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