Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGN3Q15651 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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