Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SURF1Q15526 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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