Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms