Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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