Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR6A1Q15406 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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