Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD1Q15327 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ANKRD1Q15327 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ANKRD1Q15327 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms