Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK1Q15118 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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