Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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