Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNIP1Q15025 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TNIP1Q15025 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNIP1Q15025 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNIP1Q15025 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNIP1Q15025 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TNIP1Q15025 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNIP1Q15025 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNIP1Q15025 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNIP1Q15025 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
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