Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHPRHQ149N8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
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