Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMCO1Q147U7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms