Protein–RNA interactions for Protein: Q14141

SEPT6, Septin-6, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT6Q14141 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEPT6Q14141 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT6Q14141 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms