Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNIQ14094 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNIQ14094 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNIQ14094 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNIQ14094 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNIQ14094 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNIQ14094 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNIQ14094 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNIQ14094 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNIQ14094 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNIQ14094 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNIQ14094 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNIQ14094 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNIQ14094 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNIQ14094 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNIQ14094 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNIQ14094 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNIQ14094 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNIQ14094 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNIQ14094 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNIQ14094 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNIQ14094 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNIQ14094 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNIQ14094 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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