Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CNGB1Q14028 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
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