Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE7AQ13946 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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