Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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