Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA9Q13797 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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ITGA9Q13797 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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