Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PKD2Q13563 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
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