Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
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