Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PICALMQ13492 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
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