Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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TMED1Q13445 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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TMED1Q13445 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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TMED1Q13445 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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TMED1Q13445 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TMED1Q13445 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
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