Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B2Q13435 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
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