Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SP140Q13342 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SP140Q13342 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SP140Q13342 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SP140Q13342 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SP140Q13342 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SP140Q13342 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SP140Q13342 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SP140Q13342 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SP140Q13342 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP140Q13342 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP140Q13342 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP140Q13342 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP140Q13342 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP140Q13342 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP140Q13342 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP140Q13342 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP140Q13342 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP140Q13342 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP140Q13342 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP140Q13342 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP140Q13342 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SP140Q13342 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SP140Q13342 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SP140Q13342 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SP140Q13342 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SP140Q13342 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SP140Q13342 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SP140Q13342 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SP140Q13342 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SP140Q13342 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SP140Q13342 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SP140Q13342 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SP140Q13342 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SP140Q13342 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SP140Q13342 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SP140Q13342 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP140Q13342 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP140Q13342 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP140Q13342 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SP140Q13342 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP140Q13342 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP140Q13342 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP140Q13342 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP140Q13342 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP140Q13342 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP140Q13342 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP140Q13342 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP140Q13342 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP140Q13342 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SP140Q13342 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SP140Q13342 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SP140Q13342 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SP140Q13342 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SP140Q13342 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SP140Q13342 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SP140Q13342 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SP140Q13342 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SP140Q13342 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SP140Q13342 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SP140Q13342 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SP140Q13342 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SP140Q13342 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SP140Q13342 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SP140Q13342 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SP140Q13342 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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SP140Q13342 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SP140Q13342 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SP140Q13342 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SP140Q13342 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SP140Q13342 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SP140Q13342 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SP140Q13342 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP140Q13342 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP140Q13342 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP140Q13342 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP140Q13342 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP140Q13342 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP140Q13342 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP140Q13342 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP140Q13342 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SP140Q13342 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP140Q13342 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SP140Q13342 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP140Q13342 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP140Q13342 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SP140Q13342 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SP140Q13342 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SP140Q13342 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SP140Q13342 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SP140Q13342 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SP140Q13342 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SP140Q13342 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SP140Q13342 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP140Q13342 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP140Q13342 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP140Q13342 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP140Q13342 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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