Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TRMT10B-204ENST00000488673 1443 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 ARFIP1-201ENST00000353617 3111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 ARFIP1-205ENST00000451320 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 GAPDHP28-201ENST00000455134 1003 ntBASIC10.29□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 TAF1B-205ENST00000434858 1592 ntTSL 29.74□□□□□ -0.852e-11■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 ANKHD1-EIF4EBP3-201ENST00000437495 2243 ntTSL 59.38□□□□□ -0.912e-20■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 KCTD6-201ENST00000355076 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -12e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAAL1-215ENST00000534721 510 ntTSL 38.79□□□□□ -12e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 UBE2E3-204ENST00000602303 654 ntTSL 58.58□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAAL1-206ENST00000530237 471 ntTSL 26.93□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAAL1-207ENST00000530436 604 ntTSL 36.81□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 CLASP2-207ENST00000464961 6273 ntTSL 26.77□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAAL1-211ENST00000531751 949 ntTSL 56.59□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 ANKHD1-EIF4EBP3-202ENST00000474060 5446 ntTSL 26.51□□□□□ -1.372e-20■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAAL1-212ENST00000532403 396 ntTSL 56.17□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 NSMCE4A-208ENST00000477289 643 ntTSL 25.27□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 RPAP2-201ENST00000477322 755 ntTSL 25.13□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.682e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 NSMCE4A-203ENST00000459911 541 ntTSL 24.32□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 PHIP-202ENST00000479165 5694 ntTSL 1 (best)1.82□□□□□ -2.122e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 RRBP1-207ENST00000468428 2200 ntTSL 218.25■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 PPP4C-209ENST00000566749 1490 ntTSL 529.42■■■□□ 2.31e-6■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.211e-6■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.121e-6■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 PPP4C-205ENST00000563200 1447 ntTSL 526.28■■□□□ 1.81e-6■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 BCORL1-203ENST00000456822 5648 ntTSL 515.42■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.655e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 NECTIN2-203ENST00000585601 650 ntTSL 319.05■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 NECTIN2-205ENST00000591581 950 ntTSL 216.32■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.13e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.583e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.223e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.23e-7■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.172e-8■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.172e-8■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 NME1-206ENST00000475573 781 ntTSL 319.02■□□□□ 0.642e-8■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.53e-15■■■■■ 32.2
PABPC4Q13310 MIIP-207ENST00000498685 1392 ntTSL 221.05■□□□□ 0.965e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 MIIP-203ENST00000466860 1709 ntTSL 520.02■□□□□ 0.795e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 MIIP-202ENST00000460823 955 ntTSL 517.59■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.844e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 TRAPPC1-202ENST00000540486 759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 TRAPPC1-203ENST00000571739 648 ntTSL 310.3□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.838e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.748e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.438e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.298e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.868e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.728e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 TMPO-209ENST00000549938 696 ntTSL 425.74■■□□□ 1.718e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.688e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.621e-9■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.451e-9■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CD24-205ENST00000619869 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 423.96■■□□□ 1.431e-9■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.388e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.38e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CHCHD6-207ENST00000514908 713 ntTSL 323■■□□□ 1.278e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.248e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CHCHD6-202ENST00000503119 1148 ntTSL 1 (best)22.71■■□□□ 1.238e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CD33-207ENST00000601785 1522 ntTSL 522.69■■□□□ 1.228e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 TMPO-205ENST00000546828 564 ntTSL 522.1■■□□□ 1.138e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.098e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.051e-9■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 TMPO-208ENST00000548911 540 ntTSL 521.34■■□□□ 1.018e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.968e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 RFK-202ENST00000472900 753 ntTSL 320.95■□□□□ 0.941e-9■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 320.77■□□□□ 0.928e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.878e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.798e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.768e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.78e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.698e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CHCHD6-208ENST00000515867 778 ntTSL 518.98■□□□□ 0.638e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.61e-9■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.598e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.591e-9■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.358e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 GBGT1-205ENST00000470431 2870 ntTSL 1 (best)16.46■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 AKAP9-210ENST00000486313 584 ntTSL 316.46■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.158e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 GBGT1-206ENST00000472281 2948 ntTSL 215.67■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.098e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 TCEA1-207ENST00000521086 2966 ntTSL 1 (best)15.35■□□□□ 0.058e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-9■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.058e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.058e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 32.1
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