Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME3Q13232 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME3Q13232 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME3Q13232 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NME3Q13232 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME3Q13232 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NME3Q13232 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME3Q13232 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME3Q13232 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME3Q13232 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME3Q13232 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME3Q13232 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME3Q13232 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME3Q13232 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME3Q13232 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME3Q13232 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME3Q13232 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME3Q13232 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME3Q13232 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME3Q13232 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NME3Q13232 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME3Q13232 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME3Q13232 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME3Q13232 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME3Q13232 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NME3Q13232 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME3Q13232 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME3Q13232 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME3Q13232 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME3Q13232 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME3Q13232 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME3Q13232 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME3Q13232 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME3Q13232 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME3Q13232 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME3Q13232 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NME3Q13232 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME3Q13232 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME3Q13232 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME3Q13232 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME3Q13232 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME3Q13232 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME3Q13232 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME3Q13232 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME3Q13232 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME3Q13232 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME3Q13232 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME3Q13232 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME3Q13232 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME3Q13232 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME3Q13232 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME3Q13232 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME3Q13232 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME3Q13232 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NME3Q13232 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NME3Q13232 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NME3Q13232 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME3Q13232 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME3Q13232 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME3Q13232 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME3Q13232 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME3Q13232 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NME3Q13232 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NME3Q13232 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME3Q13232 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME3Q13232 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME3Q13232 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME3Q13232 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME3Q13232 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME3Q13232 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME3Q13232 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME3Q13232 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME3Q13232 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME3Q13232 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME3Q13232 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME3Q13232 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NME3Q13232 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME3Q13232 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME3Q13232 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME3Q13232 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME3Q13232 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME3Q13232 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME3Q13232 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME3Q13232 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME3Q13232 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME3Q13232 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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